Muzeum Inżynierii Miejskiej użytkuje nieruchomości (budynki, place) położone na działce nr 125/4 obr. 12 Kraków Śródmieście przy ulicy Św. Wawrzyńca 15 (KW208471). Nieruchomości wraz z działką, na której stoją, są własnościa Gminy Miejskiej Kraków. Muzeum korzysta z nich na podstawie zawartych z Właścicielem umów na użytkowanie nieruchomości. Użytkowanie na 25 lat dotyczy wszystkich nieruchomości stojących na działce nr 125/4.